Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
MARCH6O60337 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MARCH6O60337 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MARCH6O60337 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MARCH6O60337 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
MARCH6O60337 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MARCH6O60337 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MARCH6O60337 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MARCH6O60337 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms