Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DCXO43602 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DCXO43602 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DCXO43602 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCXO43602 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCXO43602 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DCXO43602 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DCXO43602 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DCXO43602 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCXO43602 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCXO43602 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCXO43602 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCXO43602 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCXO43602 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCXO43602 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCXO43602 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DCXO43602 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCXO43602 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCXO43602 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCXO43602 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCXO43602 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
DCXO43602 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCXO43602 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DCXO43602 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DCXO43602 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DCXO43602 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DCXO43602 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DCXO43602 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DCXO43602 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DCXO43602 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DCXO43602 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DCXO43602 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCXO43602 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCXO43602 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCXO43602 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCXO43602 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCXO43602 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCXO43602 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DCXO43602 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DCXO43602 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DCXO43602 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DCXO43602 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DCXO43602 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DCXO43602 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DCXO43602 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DCXO43602 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DCXO43602 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DCXO43602 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DCXO43602 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DCXO43602 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DCXO43602 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DCXO43602 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DCXO43602 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DCXO43602 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DCXO43602 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DCXO43602 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DCXO43602 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DCXO43602 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DCXO43602 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCXO43602 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DCXO43602 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DCXO43602 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCXO43602 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DCXO43602 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCXO43602 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DCXO43602 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCXO43602 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCXO43602 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCXO43602 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCXO43602 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCXO43602 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DCXO43602 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCXO43602 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCXO43602 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCXO43602 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCXO43602 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCXO43602 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCXO43602 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DCXO43602 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCXO43602 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCXO43602 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DCXO43602 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCXO43602 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DCXO43602 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DCXO43602 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DCXO43602 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCXO43602 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCXO43602 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCXO43602 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DCXO43602 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCXO43602 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCXO43602 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCXO43602 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCXO43602 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DCXO43602 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCXO43602 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCXO43602 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCXO43602 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCXO43602 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DCXO43602 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms