Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1GO43497 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1GO43497 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1GO43497 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA1GO43497 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNA1GO43497 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1GO43497 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNA1GO43497 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1GO43497 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1GO43497 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1GO43497 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1GO43497 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1GO43497 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1GO43497 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1GO43497 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1GO43497 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNA1GO43497 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1GO43497 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNA1GO43497 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNA1GO43497 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1GO43497 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1GO43497 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA1GO43497 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms