Protein–RNA interactions for Protein: O43257

ZNHIT1, Zinc finger HIT domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT1O43257 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNHIT1O43257 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNHIT1O43257 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNHIT1O43257 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNHIT1O43257 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNHIT1O43257 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNHIT1O43257 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNHIT1O43257 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNHIT1O43257 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNHIT1O43257 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNHIT1O43257 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNHIT1O43257 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNHIT1O43257 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNHIT1O43257 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNHIT1O43257 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNHIT1O43257 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNHIT1O43257 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms