Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUPL2O15504 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUPL2O15504 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NUPL2O15504 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUPL2O15504 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms