Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IKBKBO14920 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
IKBKBO14920 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IKBKBO14920 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IKBKBO14920 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
IKBKBO14920 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IKBKBO14920 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IKBKBO14920 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms