Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2CO00762 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
UBE2CO00762 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
UBE2CO00762 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE2CO00762 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBE2CO00762 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBE2CO00762 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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