Protein–RNA interactions for Protein: K7ERE1

TMEM256-PLSCR3, TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM256-PLSCR3K7ERE1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms