Protein–RNA interactions for Protein: F8VZ95

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VZ95 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
F8VZ95 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
F8VZ95 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
F8VZ95 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
F8VZ95 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
F8VZ95 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
F8VZ95 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
F8VZ95 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
F8VZ95 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
F8VZ95 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
F8VZ95 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
F8VZ95 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
F8VZ95 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
F8VZ95 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
F8VZ95 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
F8VZ95 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
F8VZ95 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
F8VZ95 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
F8VZ95 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
F8VZ95 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
F8VZ95 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
F8VZ95 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
F8VZ95 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
F8VZ95 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
F8VZ95 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
F8VZ95 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
F8VZ95 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
F8VZ95 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
F8VZ95 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
F8VZ95 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
F8VZ95 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
F8VZ95 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
F8VZ95 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
F8VZ95 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
F8VZ95 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
F8VZ95 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
F8VZ95 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
F8VZ95 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
F8VZ95 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
F8VZ95 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
F8VZ95 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
F8VZ95 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
F8VZ95 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
F8VZ95 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
F8VZ95 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
F8VZ95 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
F8VZ95 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
F8VZ95 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
F8VZ95 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
F8VZ95 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
F8VZ95 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
F8VZ95 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
F8VZ95 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
F8VZ95 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
F8VZ95 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
F8VZ95 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
F8VZ95 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
F8VZ95 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
F8VZ95 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
F8VZ95 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
F8VZ95 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
F8VZ95 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
F8VZ95 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
F8VZ95 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
F8VZ95 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
F8VZ95 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
F8VZ95 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
F8VZ95 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
F8VZ95 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
F8VZ95 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
F8VZ95 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
F8VZ95 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
F8VZ95 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
F8VZ95 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
F8VZ95 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
F8VZ95 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
F8VZ95 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
F8VZ95 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
F8VZ95 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
F8VZ95 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
F8VZ95 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
F8VZ95 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
F8VZ95 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
F8VZ95 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
F8VZ95 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
F8VZ95 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
F8VZ95 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
F8VZ95 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
F8VZ95 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
F8VZ95 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
F8VZ95 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
F8VZ95 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
F8VZ95 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
F8VZ95 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
F8VZ95 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
F8VZ95 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
F8VZ95 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
F8VZ95 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
F8VZ95 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
F8VZ95 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms