Protein–RNA interactions for Protein: E9PYH6

Setd1a, SET domain-containing 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1aE9PYH6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Setd1aE9PYH6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Setd1aE9PYH6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Setd1aE9PYH6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.34
Setd1aE9PYH6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Setd1aE9PYH6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Setd1aE9PYH6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Setd1aE9PYH6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Setd1aE9PYH6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Setd1aE9PYH6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Setd1aE9PYH6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Setd1aE9PYH6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Setd1aE9PYH6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Setd1aE9PYH6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Setd1aE9PYH6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Setd1aE9PYH6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Setd1aE9PYH6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Setd1aE9PYH6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Setd1aE9PYH6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Setd1aE9PYH6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Setd1aE9PYH6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Setd1aE9PYH6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Setd1aE9PYH6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Setd1aE9PYH6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Setd1aE9PYH6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Setd1aE9PYH6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Setd1aE9PYH6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Setd1aE9PYH6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Setd1aE9PYH6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Setd1aE9PYH6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Setd1aE9PYH6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Setd1aE9PYH6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Setd1aE9PYH6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Setd1aE9PYH6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Setd1aE9PYH6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Setd1aE9PYH6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Setd1aE9PYH6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Setd1aE9PYH6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Setd1aE9PYH6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Setd1aE9PYH6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Setd1aE9PYH6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Setd1aE9PYH6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Setd1aE9PYH6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Setd1aE9PYH6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Setd1aE9PYH6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Setd1aE9PYH6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Setd1aE9PYH6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Setd1aE9PYH6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Setd1aE9PYH6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Setd1aE9PYH6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Setd1aE9PYH6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Setd1aE9PYH6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Setd1aE9PYH6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Setd1aE9PYH6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Setd1aE9PYH6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Setd1aE9PYH6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Setd1aE9PYH6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Setd1aE9PYH6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Setd1aE9PYH6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Setd1aE9PYH6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Setd1aE9PYH6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Setd1aE9PYH6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Setd1aE9PYH6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Setd1aE9PYH6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Setd1aE9PYH6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Setd1aE9PYH6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Setd1aE9PYH6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Setd1aE9PYH6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Setd1aE9PYH6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Setd1aE9PYH6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Setd1aE9PYH6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Setd1aE9PYH6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Setd1aE9PYH6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Setd1aE9PYH6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Setd1aE9PYH6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Setd1aE9PYH6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Setd1aE9PYH6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Setd1aE9PYH6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Setd1aE9PYH6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Setd1aE9PYH6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Setd1aE9PYH6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Setd1aE9PYH6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Setd1aE9PYH6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Setd1aE9PYH6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Setd1aE9PYH6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Setd1aE9PYH6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Setd1aE9PYH6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Setd1aE9PYH6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms