Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP99D6REC4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP99D6REC4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP99D6REC4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP99D6REC4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP99D6REC4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP99D6REC4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP99D6REC4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP99D6REC4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP99D6REC4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP99D6REC4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP99D6REC4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP99D6REC4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP99D6REC4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP99D6REC4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP99D6REC4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP99D6REC4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP99D6REC4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms