Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRBOX1C9JBD0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRBOX1C9JBD0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRBOX1C9JBD0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRBOX1C9JBD0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRBOX1C9JBD0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRBOX1C9JBD0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRBOX1C9JBD0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRBOX1C9JBD0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRBOX1C9JBD0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRBOX1C9JBD0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRBOX1C9JBD0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRBOX1C9JBD0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRBOX1C9JBD0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRBOX1C9JBD0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRBOX1C9JBD0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRBOX1C9JBD0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRBOX1C9JBD0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms