Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00587B1AMM8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00587B1AMM8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00587B1AMM8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00587B1AMM8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00587B1AMM8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00587B1AMM8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms