Protein–RNA interactions for Protein: A6NNN8

SLC38A8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A8A6NNN8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC38A8A6NNN8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC38A8A6NNN8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC38A8A6NNN8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC38A8A6NNN8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC38A8A6NNN8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC38A8A6NNN8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC38A8A6NNN8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC38A8A6NNN8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC38A8A6NNN8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC38A8A6NNN8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC38A8A6NNN8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC38A8A6NNN8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC38A8A6NNN8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC38A8A6NNN8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC38A8A6NNN8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC38A8A6NNN8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC38A8A6NNN8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC38A8A6NNN8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC38A8A6NNN8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC38A8A6NNN8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC38A8A6NNN8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC38A8A6NNN8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC38A8A6NNN8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC38A8A6NNN8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC38A8A6NNN8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC38A8A6NNN8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC38A8A6NNN8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC38A8A6NNN8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC38A8A6NNN8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC38A8A6NNN8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC38A8A6NNN8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC38A8A6NNN8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC38A8A6NNN8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC38A8A6NNN8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC38A8A6NNN8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC38A8A6NNN8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC38A8A6NNN8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms