Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SRRM3A6NNA2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRRM3A6NNA2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRRM3A6NNA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SRRM3A6NNA2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRRM3A6NNA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SRRM3A6NNA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRRM3A6NNA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SRRM3A6NNA2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms