Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC69A6NI79 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC69A6NI79 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC69A6NI79 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC69A6NI79 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC69A6NI79 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC69A6NI79 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC69A6NI79 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC69A6NI79 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC69A6NI79 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC69A6NI79 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC69A6NI79 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC69A6NI79 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC69A6NI79 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC69A6NI79 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC69A6NI79 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC69A6NI79 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC69A6NI79 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC69A6NI79 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC69A6NI79 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC69A6NI79 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC69A6NI79 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC69A6NI79 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CCDC69A6NI79 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC69A6NI79 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC69A6NI79 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC69A6NI79 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC69A6NI79 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC69A6NI79 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC69A6NI79 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC69A6NI79 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms