Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM187AA6NFU0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM187AA6NFU0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM187AA6NFU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM187AA6NFU0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FAM187AA6NFU0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM187AA6NFU0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM187AA6NFU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM187AA6NFU0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM187AA6NFU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM187AA6NFU0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM187AA6NFU0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM187AA6NFU0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM187AA6NFU0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM187AA6NFU0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM187AA6NFU0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM187AA6NFU0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM187AA6NFU0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM187AA6NFU0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM187AA6NFU0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM187AA6NFU0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM187AA6NFU0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM187AA6NFU0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM187AA6NFU0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM187AA6NFU0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM187AA6NFU0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM187AA6NFU0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM187AA6NFU0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM187AA6NFU0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM187AA6NFU0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM187AA6NFU0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM187AA6NFU0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM187AA6NFU0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM187AA6NFU0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM187AA6NFU0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM187AA6NFU0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms