Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP73A6NFT4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP73A6NFT4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP73A6NFT4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP73A6NFT4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP73A6NFT4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP73A6NFT4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP73A6NFT4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP73A6NFT4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP73A6NFT4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP73A6NFT4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP73A6NFT4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP73A6NFT4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP73A6NFT4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CFAP73A6NFT4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFAP73A6NFT4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms