Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PRAMEF22A3QJZ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRAMEF22A3QJZ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRAMEF22A3QJZ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRAMEF22A3QJZ6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRAMEF22A3QJZ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PRAMEF22A3QJZ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRAMEF22A3QJZ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRAMEF22A3QJZ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRAMEF22A3QJZ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRAMEF22A3QJZ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRAMEF22A3QJZ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRAMEF22A3QJZ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PRAMEF22A3QJZ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRAMEF22A3QJZ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRAMEF22A3QJZ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PRAMEF22A3QJZ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRAMEF22A3QJZ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRAMEF22A3QJZ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRAMEF22A3QJZ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRAMEF22A3QJZ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRAMEF22A3QJZ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRAMEF22A3QJZ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRAMEF22A3QJZ6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PRAMEF22A3QJZ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRAMEF22A3QJZ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRAMEF22A3QJZ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRAMEF22A3QJZ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRAMEF22A3QJZ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRAMEF22A3QJZ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRAMEF22A3QJZ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRAMEF22A3QJZ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PRAMEF22A3QJZ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PRAMEF22A3QJZ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRAMEF22A3QJZ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PRAMEF22A3QJZ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PRAMEF22A3QJZ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRAMEF22A3QJZ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRAMEF22A3QJZ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRAMEF22A3QJZ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PRAMEF22A3QJZ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRAMEF22A3QJZ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRAMEF22A3QJZ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PRAMEF22A3QJZ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PRAMEF22A3QJZ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRAMEF22A3QJZ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PRAMEF22A3QJZ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PRAMEF22A3QJZ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PRAMEF22A3QJZ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms