Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB1

MEIOC, Meiosis-specific coiled-coil domain-containing protein MEIOC, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIOCA2RUB1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIOCA2RUB1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIOCA2RUB1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIOCA2RUB1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIOCA2RUB1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIOCA2RUB1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIOCA2RUB1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms