Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB1

MEIOC, Meiosis-specific coiled-coil domain-containing protein MEIOC, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIOCA2RUB1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIOCA2RUB1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MEIOCA2RUB1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIOCA2RUB1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MEIOCA2RUB1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIOCA2RUB1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MEIOCA2RUB1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEIOCA2RUB1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEIOCA2RUB1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MEIOCA2RUB1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEIOCA2RUB1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEIOCA2RUB1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms