Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX44

TRBV5-5, T-cell receptor beta variable 5-5 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-5A0A0J9YX44 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV5-5A0A0J9YX44 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TRBV5-5A0A0J9YX44 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRBV5-5A0A0J9YX44 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV5-5A0A0J9YX44 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
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TRBV5-5A0A0J9YX44 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRBV5-5A0A0J9YX44 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV5-5A0A0J9YX44 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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