Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J264

TRAV38-1, T-cell receptor alpha variable 38-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV38-1A0A0B4J264 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAV38-1A0A0B4J264 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAV38-1A0A0B4J264 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAV38-1A0A0B4J264 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAV38-1A0A0B4J264 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAV38-1A0A0B4J264 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV38-1A0A0B4J264 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV38-1A0A0B4J264 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV38-1A0A0B4J264 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV38-1A0A0B4J264 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV38-1A0A0B4J264 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV38-1A0A0B4J264 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV38-1A0A0B4J264 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV38-1A0A0B4J264 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms