Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6Q4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A075B6Q4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A075B6Q4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A075B6Q4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A075B6Q4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A075B6Q4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A075B6Q4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A075B6Q4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A075B6Q4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A075B6Q4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A075B6Q4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A075B6Q4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A075B6Q4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A075B6Q4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A075B6Q4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A075B6Q4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A075B6Q4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A075B6Q4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A075B6Q4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A075B6Q4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A075B6Q4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A075B6Q4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A075B6Q4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A075B6Q4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A075B6Q4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A075B6Q4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A075B6Q4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A075B6Q4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A075B6Q4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A075B6Q4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A075B6Q4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A075B6Q4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms