Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6I4

IGLV10-54, Immunoglobulin lambda variable 10-54, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV10-54A0A075B6I4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGLV10-54A0A075B6I4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGLV10-54A0A075B6I4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IGLV10-54A0A075B6I4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGLV10-54A0A075B6I4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGLV10-54A0A075B6I4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms