Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB11Q9Y547 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB11Q9Y547 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms