Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
RAD54L2Q9Y4B4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RAD54L2Q9Y4B4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
RAD54L2Q9Y4B4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RAD54L2Q9Y4B4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RAD54L2Q9Y4B4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RAD54L2Q9Y4B4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RAD54L2Q9Y4B4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RAD54L2Q9Y4B4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms