Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
R3HCC1Q9Y3T6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
R3HCC1Q9Y3T6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms