Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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HCN4Q9Y3Q4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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HCN4Q9Y3Q4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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HCN4Q9Y3Q4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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HCN4Q9Y3Q4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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HCN4Q9Y3Q4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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HCN4Q9Y3Q4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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HCN4Q9Y3Q4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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HCN4Q9Y3Q4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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HCN4Q9Y3Q4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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HCN4Q9Y3Q4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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HCN4Q9Y3Q4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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HCN4Q9Y3Q4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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