Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC4Q9Y296 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms