Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP3Q9Y228 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP3Q9Y228 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms