Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms