Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX7Q9UNH6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX7Q9UNH6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms