Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCDHA12Q9UN75 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHA12Q9UN75 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms