Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARX2Q9UMQ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms