Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TPCN1Q9ULQ1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TPCN1Q9ULQ1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms