Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3C4Q9UKN8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF3C4Q9UKN8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms