Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJD2Q9UKL4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD2Q9UKL4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms