Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXW11Q9UKB1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms