Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC23Q9UJX2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms