Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PUF60Q9UHX1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PUF60Q9UHX1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms