Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWAP70Q9UH65 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms