Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMGXB4Q9UGU5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms