Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNA9Q9UGM1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms