Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NKX1-2Q9UD57 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms