Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms