Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TFIP11Q9UBB9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFIP11Q9UBB9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms