Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms