Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms