Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL20A1Q9P218 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL20A1Q9P218 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms