Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNKQ9P0W0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNKQ9P0W0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms